La asignatura de Química de los productos naturales se presenta como un núcleo de profundización y  constituye una fase importante en la formación del profesional en Química que quiera enfocar su actividad investigativa en esta área.  Esta asignatura se ha dividido en 8 unidades que introducen al estudiante a la química de los productos naturales. Contienen conceptos generales sobre preparación de muestras, aspectos generales de la biogénesis de los principales metabolitos primarios y secundarios existentes en las plantas. En la introducción y en algunas unidades se hará un breve repaso sobre metabolitos primarios para entrar luego a estudiar más en detalle las principales rutas metabólicas y el aislamiento y caracterización de productos naturales. Las prácticas de laboratorio están relacionadas con la extracción, purificación e identificación de metabolitos secundarios.